Совет молодых ученых НИИ психического здоровья координирует развитие профессионального сотрудничества молодых специалистов, работающих в области психиатрического здравоохранения, содействует информационному обеспечению научных исследований молодых учёных, популяризации научно-технического творчества, в том числе в электронных средствах массовой информации. Участниками Совета являются как работающие специалисты — практикующие психиатры, наркологи, психотерапевты, клинические психологи и другие молодые специалисты, занятые в практической, научно-исследовательской или педагогической деятельности в области охраны психического здоровья, в возрасте до 40 лет включительно, так и проходящие обучение в ординатуре и аспирантуре.
Совет молодых ученых НИИ психического здоровья также входит в состав Томского регионального отделения Совета молодых ученых Российского общества психиатров (Томское РО СМУ РОП).